Шюцкоры, как и красные гвардии, были созданы в результате революции в России. На рубеже 1917–18 годов шюцкоры были недостаточно подготовлены, оборудованы и организованы. Учителями-инструкторами изначально служили офицеры и унтер-офицеры старой армии. Егеря, вернувшиеся в Финляндию после прохождения обучения и службы в Германии, оказали потом эффективную помощь в обучении членов шюцкоров.
На начальном этапе руководителей остро не хватало. Поэтому в Вымпели был проведен двухнедельный курс подготовки студентов к руководящим функциям. Всего учеников было около двухсот. Учителями-инструкторами были егеря. Военное училище Вымпели считается началом подготовки финских офицеров-резервистов.
В Выборге 19 января 1918 года вспыхнуло вооруженное столкновение местного шюцкора и красной гвардии. Шюцкор был вынужден отступить из города, и в последующие дни несколько раз сражался с красными за владение железной дорогой Выборг — Санкт-Петербург. Вооруженные столкновения между шюцкорами и красногвардейцами были и в других населенных пунктах.
25 января 1918 года Сенат Финляндии, получив полномочия от нового парламента на установление правопорядка, придал шюцкорам статус правительственных войск.
26–27 января красногвардейцы начали революцию в Хельсинки. В течение следующего дня шюцкоры под руководством генерала Маннергейма начали разоружение русских гарнизонов в Остроботнии. Завязалась война, которая получила характер гражданской войны.
В Вёюри 26 января началась подготовка унтер-офицеров для белой армии. Однако уже на второй день курса 1400 учеников были вынуждены участвовать в боевых действиях. Обучение продолжалось во время военных действий на протяжении всей войны и закончилось к концу мая 1918 года.
В начале войны в боях участвовали почти 20 000 добровольцев из шюцкоров и 200 егерей. В начале линия фронта между шюцкорами и красногвардейцами проходила на рубеже Пори—Вилппула—Мянтюхарью—Антреа. В Южной Финляндии подразделения шюцкоров были вынуждены отойти к северу, где они завладели всеми населенными пунктами в течение февраля 1918 года и поддерживали там порядок.
В феврале красногвардейцы начали генеральное наступление к северу, но шюцкоры отразили удар. Белая армия пополнила свои ряды первыми егерями, но этого было недостаточно. В конце февраля правительство приняло Закон о всеобщей воинской обязанности. Основная группа егерей приступила к обучению призывников.
Главнокомандующий белыми войсками генерал Маннергейм не мог дожидаться завершения пополнения войск. В середине марта он начал наступление на город Тампере силами, сформированными из личного состава шюцкоров. Тампере был окружен, но штурм города не удавался до начала апреля. В конце концов Тампере был взят войсками Маннергейма, что стало переломным моментом для последующего хода войны. На последних этапах войны главную роль играли немецкие и финские регулярные войска.
В конце войны 16 мая 1918 года Белая армия провела в Хельсинки парад, c участием 12 000 солдат и офицеров. В параде также участвовали 4700 членов из шюцкоров.
В течение весны 1918 года шюцкоры арестовали и допросили взятых в плен красных и организовали полевые суды. Кроме того, разведывательные отряды шюцкоров собирали данные о гражданах, отбирая подозреваемых в связях с красногвардейцами. Представители шюцкоров посещали лагеря для военнопленных, чтобы опознать местных красногвардейцев для вынесения последующего приговора и наказания. После мая функции правосудия были переданы судебной системе государства.
Шюцкоры продолжали охранение объектов и выполняли обязанности охранников в лагерях для военнопленных.
После войны оборона Финляндии планировалась под руководством немцев. Создание новых шюцкоров было запрещено, округа шюцкоров отменены. Казалось, что в системе обороны молодого государства не будет места для добровольной вооруженной организации, как шюцкоры.